生产苜蓿种子与苜蓿干草在生产管理措施上存在显著差异。各大国际种子公司的权威人士对此均发表了一些看法。 FGI负责苜蓿种子生产的总裁Arias认为，两者的差异尤其表现在用水量和植株密度上。干草生产大约需要3700方水，而种子生产需水量仅需要一半或更少。用于干草生产时需种量约为1.5-1.87kg/亩，而用于种子生产时则仅需要0.07-0.14kg/亩。 Dairyland种子公司苜蓿运营经理Gross认为，干燥的气候条件是种子生产必不可少的因素，所以爱达荷州、华盛顿、俄勒冈、加利福尼亚、内华达、犹他、蒙大拿和怀俄明州成为主要的苜蓿种子生产基地。而且这些地区的土壤类型特殊，对种子生产更为有利。理想状态下，种子生产要求土壤Ph在6-8之间，对土壤肥力的要求并不严格，但是要求土壤排水良好，否则会严重影响其正常的开花过程，继而影响授粉和产量。 Arias认为，田间焚烧残茬非常必要，可以有效控制病虫害。 除了土壤和气候条件外，蜂在种子生产中起到至关重要的作用，没有它进行传粉，种子生产几乎不可能。目前生产者大多使用切叶蜂，但还有一些生产者仍然使用蜜蜂，尤以加利福尼亚州居多，由于这种蜂会延长授粉的时间，所以当地的生产者正在逐步用切叶蜂来代替蜜蜂进行传粉。在华盛顿州种子生产区有的生产者使用野蜂，一般使用量为1.87-2.49升/亩。 目前世界上苜蓿种子生产面临的最大问题就是病虫害管理，特别是盲蝽的防治。盲蝽严重危害芽、花和种子，如果不能有效防治的话，种子产量会大幅降低。由于美国生产种子的地区气候比较干旱，所以不必过分担心象霉菌病等病害的发生，但是如果在加拿大则必须考虑使用杀菌剂来防治病害。 种子收获后，经过网筛机、比重清选机和绒布式清选机等程序进行清选而后包装。包装袋最好是纸质外袋，塑料或聚乙烯内袋。包装袋上产品标签一定要符合联邦种子法要求，注明产地、种类和等级。 在一个生长季结束后，一定要及时浇水，恢复地下水位。进入冬季后，苜蓿仍需有充分的水分保证。 成功范例：华盛顿州的一名种子生产者在10、11、12月有时甚至在1月都进行灌溉，每次用26.5升左右喷嘴漫灌48小时。冬季过后，马上施肥，并且焚烧残茬，有效降低一些病虫害的发生概率。三月初，再进行一次48小时灌溉处理，确保整个生长季水分供应。